近年，在河道湖泊水体修复中，磁分离技术以其处理水量大、设备占地小、运行效果稳定、消除黑臭效果明显等优势已经在国内很多项目上得到运用和推广。河湖水体黑臭治理应采用常态处理与短期处理相结合的思路。常态处理，就是修建纳污管网、建设城市污水处理厂。短期处理，即在尚未修建好以上基础设施的阶段，采取短期处理措施，不可因无法完全达标而不处理。首先采用“短期控源截污”，确保进入河湖水环境的污水经过处理，致水体黑臭的污染物得到削减，实现总量减排和断面达标，河湖黑臭。其次，长期来看则采用“长效控源截污”和综合治理，污水经处理达标后入河。综合生态、微生物和物化技术进行河湖系统治理，实现河湖水质和生态自净能力提升。