磁分离水体净化技术发展至今，从技术原理的论证、产品工艺的设计、实验数据的分析到终成套设备的制造涉及磁力学、流体力学、材料防护学、有机化学、生物化学等多门学科，要解决污染物磁化絮凝、吸附打捞、卸渣除泥、磁种回收、污泥排放、自动化控制等诸多技术难点，技术密集度强、科技含量高。磁分离治理技术主要包含药剂投加、磁絮凝反应、磁盘分离、磁种回收循环、污泥处理五大系统。为了进一步提高磁分离效率，稳定磁分离出水水质，优化磁盘组件、优化系统内部水力流态、开发基于来水水质和出水状态的自动加药控制系统是近年的重点研发方向之一。

此外，现有磁分离技术对悬浮物（SS），生化需氧量（COD）、总磷（TP）等有优异的去除效果，但对于有效削减氨氮（NH3-N）和深度去除COD还需要进一步研究进行突破。因此，开发与磁分离技术协同的大水量、快速反应、效果稳定的物化技术工艺，从而显著提高NH3-N、COD、SS等的去除率，进一步提高出水水质，提升河道水体环境，也是推动磁分离技术在水体环境修复治理的关键问题。